1、董事會
設置董事七人，職權包含重要人事任免、審議年度預、決算書表、解散之擬議及捐助章程修改之建議等。
2、監察人
設置監察人三人，職權包含審核年度業務報告及營運計畫、查核業務及財務報告及查核董事會之重大決議事項等。
3、稽核室
工作職掌包含規劃稽核計畫、執行稽核計畫、出具稽核報告等。
4、執行長
職權包含各項業務策畫、督導、核准及授權等事宜。
5、檢索業務處
檢索業務處依照檢索案件領域做為劃分依據，各組員額因業務需求有所不同。業務內容包含執行專利檢索等。
6、行政管理處
行政管理處依照行政事務做為劃分依據。行政事務內容包含計畫管理、資訊系統之設置管理、人事管理及財務管理等。